Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
PTPRHQ9HD43 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRHQ9HD43 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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