Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 NPIPB11-201ENST00000524087 3653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 TLR3-202ENST00000504367 2310 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 EEF1A1P8-201ENST00000419025 1388 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 TMCO5A-205ENST00000559502 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AL365204.1-201ENST00000423440 1430 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 PDZK1P1-201ENST00000401008 3498 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 OR4D6-201ENST00000300127 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 SSX2-202ENST00000337502 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 MIR425-201ENST00000362162 87 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 RPL5P31-201ENST00000399168 635 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AL589763.1-201ENST00000412257 791 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 RMDN2-AS1-201ENST00000414365 859 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 CES5AP1-202ENST00000415114 974 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 TCEAL4-202ENST00000415568 959 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 RAC1P4-201ENST00000419413 579 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AL590714.1-201ENST00000420498 379 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC006457.1-201ENST00000420733 392 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 ENTPD3-AS1-201ENST00000420850 791 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 CD46P1-201ENST00000441364 763 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AL663058.1-201ENST00000453379 353 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AL117382.2-201ENST00000455642 403 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 RN7SL834P-201ENST00000461450 286 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 RN7SL342P-201ENST00000479616 294 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 TPM3P9-202ENST00000492121 745 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC008040.4-201ENST00000494834 768 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC055733.3-201ENST00000505214 523 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC021088.1-201ENST00000506519 805 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AP000867.1-201ENST00000511464 255 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 C5orf66-203ENST00000513931 474 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC022695.2-201ENST00000518042 768 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AP001994.1-201ENST00000527539 826 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC124276.2-201ENST00000527997 550 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 OR4A11P-201ENST00000529557 906 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 STXBP6-206ENST00000548369 682 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AL049836.2-201ENST00000553318 513 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC027020.1-202ENST00000557839 429 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 LINC01852-202ENST00000559232 533 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 RRN3-206ENST00000564131 1001 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC009120.2-202ENST00000566411 679 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC134312.6-201ENST00000568587 444 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 RBM4-213ENST00000578778 582 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AP005202.3-201ENST00000582033 567 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 EIF1-207ENST00000591776 797 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 ZNF799-204ENST00000595766 576 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 SSX2B-202ENST00000596480 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 ZNF814-208ENST00000596604 528 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC025884.3-201ENST00000605422 343 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AL669942.1-206ENST00000610473 783 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.115-201ENST00000619303 284 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC139768.1-201ENST00000620274 898 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC087893.2-201ENST00000623272 255 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms