Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 LINC02477-201ENST00000512652 1417 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
R3HDM1Q15032 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.7 ms