Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ALCAMQ13740 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AC073486.1-202ENST00000458437 489 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms