Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 PLEKHA3P1-201ENST00000598554 894 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 LINC01146-207ENST00000557339 397 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 DGKB-202ENST00000402815 5595 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
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