Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 VN1R3-201ENST00000418822 919 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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