Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
HOXD10P28358 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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