Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AC096736.3-201ENST00000510753 993 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 NBPF19-206ENST00000621744 14425 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 ROBO2-201ENST00000332191 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 VPS41-202ENST00000310301 5903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 DOCK1-201ENST00000280333 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 KCNMA1-212ENST00000406533 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
PKHD1P08F94 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 ADGRF5-202ENST00000283296 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 OR2A5-202ENST00000641693 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 CHD2-201ENST00000394196 9363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 ECT2-206ENST00000417960 4363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 NCBP3-201ENST00000389005 12770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 ZCCHC2-204ENST00000586834 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 HEPH-202ENST00000343002 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms