Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AC119674.1-217ENST00000641942 1086 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
ERVV-1B6SEH8 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 IFNG-AS1-202ENST00000538665 1791 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
ERVV-1B6SEH8 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 255.8 ms