Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
COPS7AQ9UBW8 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms