Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 RNVU1-15-201ENST00000384476 165 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 TDRKH-AS1-201ENST00000389897 992 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 CCDC134-202ENST00000402061 525 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC007879.3-201ENST00000417096 556 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AL713965.1-201ENST00000421166 230 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 MIR181A2HG-201ENST00000429139 662 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 LINC01422-202ENST00000438113 517 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 DNM1P24-201ENST00000441091 490 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 OR2S1P-201ENST00000447226 950 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AL356310.1-201ENST00000452024 585 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC234771.3-201ENST00000454984 622 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 RN7SL683P-201ENST00000460552 270 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 RN7SL659P-201ENST00000483093 299 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC131210.1-201ENST00000491347 441 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 LEMD1-208ENST00000495594 637 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 RPL36P16-201ENST00000496996 306 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC104123.1-201ENST00000502645 473 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC091849.2-201ENST00000503113 692 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC226119.2-201ENST00000513501 530 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC106794.2-201ENST00000513713 632 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC087664.3-201ENST00000524110 328 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 ZNF726-203ENST00000525354 806 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AP002986.1-202ENST00000532116 669 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AP001189.4-201ENST00000533588 452 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 CACNA1C-AS2-201ENST00000545526 609 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC011611.6-201ENST00000547483 255 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 LINC02254-201ENST00000558621 1726 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC092287.1-201ENST00000565782 463 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 MIR4437-201ENST00000581331 60 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 IGLJCOR18-201ENST00000584002 424 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 RIT2-202ENST00000589109 1156 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 ST6GALNAC1-207ENST00000589992 419 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 MIR7162-201ENST00000611134 69 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC103974.2-201ENST00000611319 778 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 PCDH18-206ENST00000611581 819 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC239600.2-201ENST00000619615 1165 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AP000457.1-201ENST00000620221 378 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 Z98752.3-201ENST00000621802 566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 CU633904.1-204ENST00000624907 777 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 OR11G2-203ENST00000641879 4415 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 HEPH-201ENST00000336279 4228 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AL023495.1-201ENST00000413005 1923 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 STK33-201ENST00000315204 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 ACSL4-204ENST00000469796 5225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms