Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LETM2Q2VYF4 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LETM2Q2VYF4 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LETM2Q2VYF4 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LETM2Q2VYF4 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LETM2Q2VYF4 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LETM2Q2VYF4 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LETM2Q2VYF4 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LETM2Q2VYF4 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LETM2Q2VYF4 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LETM2Q2VYF4 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LETM2Q2VYF4 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
LETM2Q2VYF4 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LETM2Q2VYF4 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LETM2Q2VYF4 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LETM2Q2VYF4 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
LETM2Q2VYF4 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
LETM2Q2VYF4 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
LETM2Q2VYF4 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms