Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SS18Q15532 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SS18Q15532 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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SS18Q15532 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SS18Q15532 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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SS18Q15532 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SS18Q15532 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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SS18Q15532 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SS18Q15532 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
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SS18Q15532 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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SS18Q15532 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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SS18Q15532 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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SS18Q15532 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SS18Q15532 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SS18Q15532 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SS18Q15532 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SS18Q15532 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SS18Q15532 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
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SS18Q15532 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
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SS18Q15532 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SS18Q15532 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SS18Q15532 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SS18Q15532 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SS18Q15532 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SS18Q15532 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SS18Q15532 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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