Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms