Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF2H3Q13889 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms