Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 AC007993.1-201ENST00000621298 2430 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NCOA4Q13772 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NCOA4Q13772 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NCOA4Q13772 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NCOA4Q13772 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NCOA4Q13772 AMPD3-209ENST00000529507 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NCOA4Q13772 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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NCOA4Q13772 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NCOA4Q13772 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NCOA4Q13772 OR10D1P-201ENST00000355343 936 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NCOA4Q13772 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NCOA4Q13772 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NCOA4Q13772 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NCOA4Q13772 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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NCOA4Q13772 AC016745.1-201ENST00000422178 508 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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NCOA4Q13772 AC008753.1-201ENST00000423096 284 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NCOA4Q13772 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NCOA4Q13772 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NCOA4Q13772 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NCOA4Q13772 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NCOA4Q13772 AL356133.1-201ENST00000444762 372 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NCOA4Q13772 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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NCOA4Q13772 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NCOA4Q13772 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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NCOA4Q13772 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NCOA4Q13772 RPS26P6-201ENST00000475156 348 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NCOA4Q13772 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NCOA4Q13772 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NCOA4Q13772 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NCOA4Q13772 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NCOA4Q13772 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NCOA4Q13772 AP003467.1-201ENST00000517397 301 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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NCOA4Q13772 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NCOA4Q13772 AC130366.1-201ENST00000526505 1192 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NCOA4Q13772 AP006587.5-201ENST00000532033 739 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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NCOA4Q13772 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
NCOA4Q13772 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
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NCOA4Q13772 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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NCOA4Q13772 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
NCOA4Q13772 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NCOA4Q13772 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
NCOA4Q13772 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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