Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CDH18Q13634 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210.1 ms