Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SGCGQ13326 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.6 ms