Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 ZYG11B-201ENST00000294353 8093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 CACNB2-215ENST00000615785 3707 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 MTIF2-201ENST00000263629 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 ALS2-201ENST00000264276 6644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
TRIM28Q13263 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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