Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
CHAF1AQ13111 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
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