Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
PTPN13Q12923 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 FAM174B-202ENST00000553393 495 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
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