Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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PGGT1BP53609 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
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PGGT1BP53609 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
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PGGT1BP53609 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
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PGGT1BP53609 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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PGGT1BP53609 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
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PGGT1BP53609 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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PGGT1BP53609 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
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PGGT1BP53609 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PGGT1BP53609 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
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