Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CENPFP49454 SLC35E3-202ENST00000398004 17791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CENPFP49454 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CENPFP49454 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CENPFP49454 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 VANGL1-204ENST00000369510 8647 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 TMEM2-205ENST00000377066 5217 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CENPFP49454 MGAM-209ENST00000620571 6483 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CENPFP49454 ZNF521-203ENST00000538137 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CENPFP49454 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CENPFP49454 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CENPFP49454 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CENPFP49454 SPRYD4-201ENST00000338146 10779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CENPFP49454 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CENPFP49454 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CENPFP49454 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CENPFP49454 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CENPFP49454 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CENPFP49454 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CENPFP49454 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CENPFP49454 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CENPFP49454 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CENPFP49454 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CENPFP49454 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CENPFP49454 DLG2-211ENST00000426717 5927 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CENPFP49454 PTPRB-208ENST00000550358 6583 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CENPFP49454 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CENPFP49454 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CENPFP49454 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CENPFP49454 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CENPFP49454 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CENPFP49454 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CENPFP49454 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CENPFP49454 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CENPFP49454 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CENPFP49454 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CENPFP49454 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AC023136.1-201ENST00000513093 1105 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CENPFP49454 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CENPFP49454 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CENPFP49454 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CENPFP49454 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CENPFP49454 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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