Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 ADGRL3-205ENST00000506746 4935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
PTPRGP23470 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163 ms