Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SGCZQ96LD1 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
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