Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SS18Q15532 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SS18Q15532 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SS18Q15532 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SS18Q15532 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SS18Q15532 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SS18Q15532 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SS18Q15532 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
SS18Q15532 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SS18Q15532 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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SS18Q15532 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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SS18Q15532 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
SS18Q15532 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SS18Q15532 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SS18Q15532 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SS18Q15532 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SS18Q15532 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
SS18Q15532 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
SS18Q15532 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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