Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
IFT88Q13099 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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