Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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SH3BP4Q9P0V3 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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SH3BP4Q9P0V3 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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SH3BP4Q9P0V3 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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SH3BP4Q9P0V3 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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SH3BP4Q9P0V3 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP4Q9P0V3 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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