Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 LINC00254-202ENST00000633813 439 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
TMOD4Q9NZQ9 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TMOD4Q9NZQ9 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TMOD4Q9NZQ9 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TMOD4Q9NZQ9 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TMOD4Q9NZQ9 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TMOD4Q9NZQ9 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TMOD4Q9NZQ9 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
TMOD4Q9NZQ9 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TMOD4Q9NZQ9 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TMOD4Q9NZQ9 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TMOD4Q9NZQ9 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
TMOD4Q9NZQ9 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TMOD4Q9NZQ9 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TMOD4Q9NZQ9 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
TMOD4Q9NZQ9 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.1 ms