Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TM6SF1Q9BZW5 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TM6SF1Q9BZW5 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms