Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 AC018467.1-202ENST00000432612 533 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 ANXA2P2-201ENST00000435128 1020 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 RPS10P14-201ENST00000440748 502 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 VNN3-210ENST00000450865 596 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 SLAMF6P1-201ENST00000451067 602 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 C2orf74-204ENST00000464909 726 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 RN7SL797P-201ENST00000486314 297 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 TECRP2-201ENST00000503270 928 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AP002833.2-201ENST00000531585 462 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 OR7E161P-201ENST00000533722 967 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 RAB27A-205ENST00000564609 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AP001122.1-201ENST00000572256 541 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AC009303.2-206ENST00000588042 786 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 PRR13P5-201ENST00000596581 442 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AC211433.3-201ENST00000623770 375 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AC183089.2-201ENST00000637931 916 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 SORBS1-207ENST00000371239 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 BTN3A2-205ENST00000508906 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 CEP97-206ENST00000494050 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 MRPS27-201ENST00000261413 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 TMCO5A-205ENST00000559502 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 ZNF410-202ENST00000334521 2193 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AC007402.1-201ENST00000440698 3939 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 RPS3AP5-201ENST00000389400 821 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 MRPL32P1-201ENST00000406301 247 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 SNORA11D-201ENST00000408548 128 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 SNORA11E-201ENST00000408778 128 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AC016745.1-201ENST00000422178 508 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 UQCRHP1-204ENST00000424609 274 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AC106874.1-201ENST00000440495 646 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AL391863.1-202ENST00000457427 612 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 RN7SL325P-201ENST00000460434 283 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AC079594.1-201ENST00000489757 331 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AC008967.1-201ENST00000504843 163 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 OR7E163P-201ENST00000505943 894 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 PABPC1P1-201ENST00000506347 591 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 RPS20-202ENST00000518875 671 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 OR5M4P-201ENST00000529436 925 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AC126177.6-201ENST00000550420 1009 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 C14orf2-209ENST00000554880 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 NR2F2-AS1-209ENST00000560800 549 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 ZNF397-211ENST00000592264 1104 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AL591686.2-201ENST00000608241 475 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCG3Q8WXD2 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.6 ms