Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CTXN3Q4LDR2 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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