Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AP002833.2-201ENST00000531585 462 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC078778.2-201ENST00000553061 567 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AL390718.1-201ENST00000566904 506 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC135068.11-201ENST00000636378 921 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 OR6P1-201ENST00000334632 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 OR10R2-201ENST00000368152 1008 ntAPPRIS P2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 RBMY2EP-202ENST00000456360 940 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC096661.1-201ENST00000515870 822 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 IGHVIII-11-1-201ENST00000522733 267 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 MIR378H-201ENST00000579966 83 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC019131.1-201ENST00000583654 622 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC040963.1-201ENST00000591900 564 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC010139.1-201ENST00000596963 445 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 MIR6883-201ENST00000614952 78 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
BBS9Q3SYG4 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms