Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 LINC02342-201ENST00000627910 461 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
RUNX3Q13761 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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