Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 LINC01013-205ENST00000458028 1345 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTCH1Q13635 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.31
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PTCH1Q13635 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTCH1Q13635 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
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