Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 MYO6-201ENST00000369975 5387 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 NRXN3-203ENST00000428277 4219 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 OSGEPL1-207ENST00000522700 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 ABLIM1-214ENST00000533213 7606 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 ADAMTS9-201ENST00000295903 7060 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
TRIM28Q13263 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
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