Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
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