Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ACADSBP45954 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms