Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
NEDD8-MDP1E9PL57 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.3 ms