Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PapolbQ9WVP6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PapolbQ9WVP6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PapolbQ9WVP6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PapolbQ9WVP6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PapolbQ9WVP6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PapolbQ9WVP6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PapolbQ9WVP6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PapolbQ9WVP6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PapolbQ9WVP6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PapolbQ9WVP6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PapolbQ9WVP6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PapolbQ9WVP6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PapolbQ9WVP6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PapolbQ9WVP6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PapolbQ9WVP6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PapolbQ9WVP6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PapolbQ9WVP6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms