Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ALKQ9UM73 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ALKQ9UM73 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms