Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Eif3fQ9DCH4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms