Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9DA42 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9DA42 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9DA42 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DA42 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DA42 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DA42 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DA42 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DA42 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DA42 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DA42 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DA42 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DA42 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DA42 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DA42 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DA42 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DA42 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DA42 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DA42 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DA42 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DA42 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DA42 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DA42 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9DA42 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9DA42 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9DA42 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9DA42 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9DA42 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9DA42 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9DA42 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9DA42 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9DA42 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9DA42 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9DA42 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9DA42 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9DA42 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9DA42 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9DA42 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9DA42 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9DA42 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9DA42 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9DA42 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9DA42 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9DA42 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9DA42 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9DA42 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9DA42 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9DA42 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9DA42 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9DA42 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9DA42 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9DA42 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9DA42 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9DA42 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9DA42 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9DA42 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9DA42 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9DA42 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9DA42 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9DA42 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9DA42 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9DA42 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9DA42 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9DA42 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9DA42 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9DA42 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9DA42 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9DA42 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9DA42 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9DA42 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9DA42 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9DA42 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9DA42 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9DA42 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9DA42 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9DA42 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9DA42 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9DA42 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9DA42 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9DA42 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9DA42 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9DA42 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9DA42 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9DA42 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9DA42 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9DA42 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9DA42 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9DA42 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9DA42 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9DA42 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9DA42 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9DA42 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9DA42 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9DA42 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9DA42 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9DA42 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9DA42 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9DA42 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9DA42 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9DA42 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms