Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx5Q9D8U8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms