Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I0

Shisa5, Protein shisa-5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa5Q9D7I0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Shisa5Q9D7I0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms