Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc81Q9D5W4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms