Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PudpQ9D5U5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PudpQ9D5U5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms