Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sgo1Q9CXH7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Sgo1Q9CXH7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Sgo1Q9CXH7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Sgo1Q9CXH7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Sgo1Q9CXH7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sgo1Q9CXH7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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