Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rprd1bQ9CSU0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms