Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Pdzk1ip1Q9CQH0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdzk1ip1Q9CQH0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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